Wirus Zika zaliczany jest do rodziny Flaviviridae, rodzaju Flavivirus w skład którego wchodzi około 65 różnych, spokrewnionych ze sobą genetycznie i antygenowo wirusów.
Wirus Zika, jest przenoszonym przez komary tzw. flawiwirusem, który został po raz pierwszy zidentyfikowany w Ugandzie w 1947 roku u małp. U ludzi zidentyfikowano go w 1952 roku.
